Go to main content | Go to main menu | Go to search

Project information
Evoluce genomu alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) rozdílného fylogenetického stáří

Information

This project doesn't include Faculty of Science. It includes Central European Institute of Technology. Official project website can be found on muni.cz.
Investor logo
Project Identification
GAP501/10/1014
Project Period
1/2010 - 12/2012
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
  • Standard Projects
MU Faculty or unit
Central European Institute of Technology
Cooperating Organization
Charles University
  • Responsible person prof. RNDr. Karol Marhold, CSc.
Universität Osnabrück
  • Responsible person prof. Klaus Mummenhoff, Ph.D.
  • Responsible person Walter Bleeker
  • Responsible person Ulrike Coja

Polyploidie hraje významnou roli při speciaci semenných rostlin. Nicméně překvapivě málo je známo o stabilitě chromosomů v prvních generacích po vzniku alopolyploidů a u evolučně mladých polyploidů. Poprvé bude použita technika kombinované GISH a SMC (genomická in situ hybridizace a srovnávací malování chromosomů) u hybridních a alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) k analýze intergenomických chromosomových interakcí. GISH identifikuje rodičovské chromosomové sady a intergenomické translokace, zatímco SMC odhalí inter- a intrachromosomové přestavby. Stabilita chromosomů bude analyzována u nedávno (ca. 100 let) vzniklého triploidního hybrida C.x insueta (2n=24) a autoalohexaploida C. schulzii (2n=48), evolučně staršího druhu C. flexuosa (2n=32), a jejich domnělých rodičovských druhů. U tří analyzovaných alopolyploidních taxonů budou etablovány syntetické linie a chromosomová stabilita monitorována v posloupných generacích. Projekt ozřejmí spojitost mezi chromosomovými přestavbami a evolucí alopolyploidních genomů rostlin.

Publications

Total number of publications: 7

2017

  • Young inversion with multiple linked QTLs under selection in a hybrid zone

    LEE Cheng-Ruei WANG Baosheng MOJICA Julius P. MANDÁKOVÁ Terezie PRASAD Kasavajhala V. S. K. GOICOECHEA Jose Luis PERERA Nadeesha HELLSTEN Uffe HUNDLEY Hope N. JOHNSON Jenifer GRIMWOOD Jane BARRY Kerrie FAIRCLOUGH Stephen JENKINS Jerry W. YU Yeisoo KUDRNA Dave ZHANG Jianwei TALAG Jayson GOLSER Wolfgang GHATTAS Kathryn SCHRANZ M. Eric WING Rod LYSÁK Martin SCHMUTZ Jeremy ROKHSAR Daniel S. MITCHELL-OLDS Thomas

    Article in Periodical

    Nature Ecology and Evolution, year: 2017, volume: 1, edition: 5, DOI

2016

2014

2013

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.