Project information
Host microbiome in relation to Barrett ´s esophagus and esophageal adenocarcinoma development

Information

This project doesn't include Faculty of Science. It includes Faculty of Medicine. Official project website can be found on muni.cz.

Project Identification

NU20-03-00126

Project Period

5/2020 - 12/2023

Investor / Pogramme / Project type

Ministry of Health of the CR

Ministry of Health Research Programme 2020 - 2026
Subprogram 1 - standard

MU Faculty or unit

Faculty of Medicine

doc. RNDr. Petra Bořilová Linhartová, Ph.D., MBA
Ing. Vojtěch Bartoň
Mgr. Jan Böhm
Tina Catela Ivković, PhD
prof. MUDr. Lydie Izakovičová Hollá, Ph.D.
doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Bc. Adam Majer
Mgr. Natálie Mlčůchová
Mgr. Terezie Slámová
Mgr. Jana Šístková, Ph.D.
Mgr. Kateřina Vyklická

Other MU Faculty/Unit

Central European Institute of Technology

Cooperating Organization

University Hospital Olomouc

Responsible person Doc. MUDr. Ondřej Urban, Ph.D.

University Hospital Prague - Motol

Responsible person MUDr. Tomáš Haruštiak, Ph.D.
Responsible person prof. MUDr. Robert Lischke, Ph.D.
Responsible person Štěpán Hlava

University Hospital Brno-Bohunice

Responsible person prof. MUDr. Zdeněk Kala, CSc.
Responsible person doc. MUDr. Radek Kroupa, Ph.D.
Responsible person MUDr. Tomáš Grolich, Ph.D.
Responsible person doc. MUDr. Lumír Kunovský, Ph.D.
Responsible person Zdeněk Pavlovský
Responsible person doc. MUDr. Jiří Dolina, Ph.D.
Responsible person doc. MUDr. Vladimír Procházka, Ph.D.

Hostitelský mikrobiom spolu s genetickou predispozicí jedince jsou důležitými faktory
v etiopatogenezi refluxní choroby jícnu (GERD), která významně zvyšuje riziko rozvoje ezofagitidy (RE), Barrettova jícnu (BE) a adenokarcinomu ezofagu (EAC). Cílem projektu je determinace markerů na úrovni mikrobiomu, genů hostitele a jejich interakcí pro časnější diagnostiku a predikci rozvoje BE a EAC.
Projekt obsahuje 3 části: (1) analýzu metagenomu a metatranskriptomu v několika lokalitách
gastrointestinálního traktu (GIT) u pacientů s GERD, (2) analýzu hostitelského exomu a transkriptomu ve tkáni jícnu u pacientů s BE/EAC, a (3) analýzu genetického profilu pacientů s GERD a jeho komplikacemi. Mutace v exomu/genomu pacienta a míra exprese genů ve tkáni jícnu budou korelovány s mikrobiomem a jeho funkční aktivitou v GITu a klinickým nálezem doplněným o in vivo endomikroskopii.
Na základě získaných dat se pokusíme navrhnout modifikaci standardního režimu péče o pacienty s GERD s cílem předejít pokročilým a ireverzibilním změnám snižujícím kvalitu života pacientů, resp. ohrožujících je na životě.

Sustainable Development Goals

Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.

Publications

Total number of publications: 30

2023

WP2: Characterizing the internal and the external exposome in the cohort and case-series

BUDINSKÁ Eva BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ Petra

Conference abstract

Year: 2023, type: Conference abstract

2022

Achalasia and acromegaly: co-incidence of these diseases or a new syndrome?

DOLINA Jiří KUNOVSKÝ Lumír KROUPA Radek STARÝ Karel JABANDŽIEV Petr NEŠPOROVÁ Tereza MÁCA Karel ANDRAŠINA Tomáš MAREK Filip KALA Zdeněk VACULOVÁ Jitka SAID Dávid ZAPLETALOVÁ Martina LOCHMAN Jan PÁLOVÁ Hana SLABÝ Ondřej IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ Lydie BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ Petra

Article in Periodical

Biomedical Papers, year: 2022, volume: 166, edition: 2, DOI
CYP2C19 Gene Profiling as a Tool for Personalized Stress Ulcer Prophylaxis With Proton Pump Inhibitors in Critically Ill Patients-Recommendations Proposal

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ Petra ZENDULKA Ondřej JANOSEK Jaroslav MLČŮCHOVÁ Natálie CVANOVÁ Michaela DANĚK Zdeněk KROUPA Radek BARTOŠOVÁ Ladislava LIPOVÝ Břetislav

Article in Periodical

Frontiers in Medicine, year: 2022, volume: 9, edition: July 2022, DOI
Helicobacter analysis in gastric mucosa samples – comparison of two methodical approaches

SLÁMOVÁ Terezie MLČŮCHOVÁ Natálie KALA Zdeněk PAVLOVSKÝ Zdeněk BÖHM Jan KROUPA Radek DOLINA Jiří PROCHÁZKA Vladimír GROLICH Tomáš VACULOVÁ Jitka KUNOVSKÝ Lumír BRENEROVÁ Petra ANDRLA Petr URBAN Ondřej NAVRÁTIL Vít HARUSTIAK Tomáš LISCHKE Robert DEISSOVÁ Tereza LOCHMAN Jan IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ Lydie SLABÝ Ondřej BUDINSKÁ Eva BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ Petra

Conference abstract

Year: 2022, type: Conference abstract
Lack of Association between Epidermal Growth Factor or Its Receptor and Reflux Esophagitis, Barrett’s Esophagus, and Esophageal Adenocarcinoma: A Case-Control Study

DEISSOVÁ Tereza CVANOVÁ Michaela KALA Zdeněk JIRASKOVA ZAKOSTELSKA Zuzana DOLINA Jiří KUNOVSKÝ Lumír KROUPA Radek PAVLOVSKÝ Zdeněk LIPOVÝ Břetislav DANĚK Zdeněk IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ Lydie URBAN Ondrej NAVRATIL Vit LISCHKE Robert HARUSTIAK Tomas GROLICH Tomáš PROCHÁZKA Vladimír SLABÝ Ondřej BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ Petra

Article in Periodical

Disease Markers, year: 2022, volume: 2022, edition: August, DOI
Pharmacogenetics of proton pump inhibitors and prevalence of the CYP2C19*2 and *17 variants in the Central European population

MLČŮCHOVÁ Natálie LIPOVÝ Břetislav DANĚK Zdeněk KUNOVSKÝ Lumír ZENDULKA Ondřej PEŠ Ondřej BÖHM Jan KROUPA Radek VACULOVÁ Jitka GROLICH Tomáš PROCHÁZKA Vladimír NAVRÁTIL Vít URBAN Ondřej HARUŠTIAK Tomáš LISCHKE Robert IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ Lydie KALA Zdeněk BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ Petra

Conference abstract

Year: 2022, type: Conference abstract
Specific carbohydrate substrates affected the growth of Bacillus cereus strain isolated from an environmental sample

VYKLICKÁ Kateřina KUČERA Jiří PAŠKOVÁ Kateřina DOKULILOVA Jana ŘEMÍNEK Roman GLATZ Zdeněk BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ Petra

Conference abstract

Year: 2022, type: Conference abstract
The Use of Confocal Laser Endomicroscopy in Diagnosing Barrett’s Esophagus and Esophageal Adenocarcinoma

VACULOVÁ Jitka KROUPA Radek KALA Zdeněk DOLINA Jiří GROLICH Tomáš VLAŽNÝ Jakub SAID Dávid IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ Lydie BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ Petra PROCHÁZKA Vladimír JOUKAL Marek JABANDŽIEV Petr SLABÝ Ondřej KUNOVSKÝ Lumír

Article in Periodical

Diagnostics, year: 2022, volume: 12, edition: 7, DOI

2021