Informace o projektu
Evolution of genome size - a new role for the centromere drive
(Centrogenomtah)
- Kód projektu
- GA20-15989S
- Období řešení
- 1/2020 - 6/2023
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Jelikož mechanika buněčného dělení vyžaduje zachování poměru mezi velikostí chromosomů a kinetochorů, měly by změny ve velikosti kinetochoru být reflektovány velikostními změnami chromosomů (a v konečném důsledku i genomů). Přestože je centromerický tah („drajv“) široce akceptován jako mechanismus evoluce kinetochorů u eukaryot s asymetrickou meiózou, dopad tohoto tahu na evoluci velikosti chromosomů a velikosti genomu nebyl nikdy studován. S využitím karyologie (u mitotických metafází) a průtokové cytometrie (v interfázních jádrech) v kombinaci s imunofluorecenčním barvením proto hodláme fylogeneticky analyzovat, jak tempo v evoluci velikosti chromosomů a genomů koreluje s tempem evoluce velikosti kinetochorů a intenzitou pozitivní selekce v evoluci CenH3 napříč eukaryoty: u „drajvujících“ živočichů a semenných rostlin oproti „nedrajvujícím“ houbám, mechorostům, plavuním a kapradinám i na jemné fylogenetické škále v modelových Brassicaceae a Poaceae s jejichž využitím budou validovány a optimalizovány klíčové analytické techniky.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 16
2022
-
Chromosome size matters: genome evolution in the cyperid clade
Annals of Botany, rok: 2022, ročník: 130, vydání: 7, DOI
-
Kinetochore size scales with chromosome size in bimodal karyotypes of Agavoideae
Annals of Botany, rok: 2022, ročník: 130, vydání: 1, DOI
-
Reference standards for flow cytometric estimation of absolute nuclear DNA content in plants
Cytometry: Part A, rok: 2022, ročník: 101, vydání: 9, DOI
2021
-
Centromere Size Scales With Genome Size Across Eukaryotes
Scientific Reports, rok: 2021, ročník: 11, vydání: 1, DOI
-
Holocentric Chromosomes Probably Do Not Prevent Centromere Drive in Cyperaceae
Frontiers in Plant Science, rok: 2021, ročník: 12, vydání: February, DOI
2020
-
Is the evolution of carnivory connected with genome size reduction?
American Journal of Botany, rok: 2020, ročník: 107, vydání: 9, DOI