Informace o projektu
Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami
- Kód projektu
- IAA401630901
- Období řešení
- 1/2009 - 12/2013
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Hlavním cílem projektu je studium evoluce substrátové specifity mikrobiálních enzymů aktivních s xenobiotickými sloučeninami. Zvolený modelovým systém, halogenalkandehalogenasy, je vhodný k tomuto účelu vzhledem k aktivitě dehalogenas enzymů s biologicky špatně rozložitelnými sloučeninami, které se v biosféře nevyskytovaly před průmyslovou revolucí. Evoluce bude studována rekurzivně kvantitativním popisem substrátové specifity moderních halogenalkandehalogenas a srovnáním se specifitou předků těchto enzymů navržených fylogenetickou dedukcí a konstruovaných genovou syntézou. Konečným výsledkem této analýzy bude ohodnocení funkčního přesahu jednotlivých podrodin a podrobný popis molekulárních událostí vedoucích ke specializaci těchto enzumů umožňující účinný rozklad xenobiotických substrátů. Různé teoretické a experimentální přístupy budou použity k přípravě biologického materiálu a ke sběru dat nezbytných k testování alternativních evolučních hypotéz.
Publikace
Počet publikací: 67
2011
-
Construction of pollutant-degrading bacteria by protein and metabolic engineering
Rok: 2011, druh: Vyžádané přednášky
-
Crystallization and Crystallographic Analysis of the Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 DhaA Mutant DhaA31 and its Complex with 1,2,3-Trichloropropane
Acta Crystallographica F, rok: 2011, ročník: 67, vydání: 67, DOI
-
Crystallization and Preliminary Crystallographic Analysis of Rhodococcus rhodochrous Wild-type DhAa Protein and its Variant DhaA13 Complexed with Different Ligands
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Crystallization and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of the Wild-Type Haloalkane Dehalogenase DhaA and its Variant DhaA13 Complexed with Different Ligands
Acta Crystallographica F, rok: 2011, ročník: 67, vydání: 67, DOI
-
Crystallization and structural analysis of DhaA31 from Rhodococcus rhodochrous
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani USDA94
Crystal Growth & Design, rok: 2011, ročník: 11, vydání: 2, DOI
-
Engineering Robust and Efficient Protein Catalysts
Rok: 2011, druh: Vyžádané přednášky
-
HOTSPOT WIZARD: WEB APPLICATION FOR PROTEIN ENGINEERING AND STRUCTURAL ANNOTATION
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
In vitro protein and metabolic engineering of a biodegradation pathway
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Keyhole-Lock-Key Model of Enzymatic Catalysis
Rok: 2011, druh: Vyžádané přednášky