Informace o projektu
Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami
- Kód projektu
- IAA401630901
- Období řešení
- 1/2009 - 12/2013
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Hlavním cílem projektu je studium evoluce substrátové specifity mikrobiálních enzymů aktivních s xenobiotickými sloučeninami. Zvolený modelovým systém, halogenalkandehalogenasy, je vhodný k tomuto účelu vzhledem k aktivitě dehalogenas enzymů s biologicky špatně rozložitelnými sloučeninami, které se v biosféře nevyskytovaly před průmyslovou revolucí. Evoluce bude studována rekurzivně kvantitativním popisem substrátové specifity moderních halogenalkandehalogenas a srovnáním se specifitou předků těchto enzymů navržených fylogenetickou dedukcí a konstruovaných genovou syntézou. Konečným výsledkem této analýzy bude ohodnocení funkčního přesahu jednotlivých podrodin a podrobný popis molekulárních událostí vedoucích ke specializaci těchto enzumů umožňující účinný rozklad xenobiotických substrátů. Různé teoretické a experimentální přístupy budou použity k přípravě biologického materiálu a ke sběru dat nezbytných k testování alternativních evolučních hypotéz.
Publikace
Počet publikací: 67
2011
-
Molekulární podstata působení organických rozpouštědel na strukturu a funkci haloalkandehalogenáz
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Novosphingobium barchaimii LL02 sp. nov
Rok: 2011
-
Paroxetine Metabolization and Cytochrome P450 2D6: Towards Predictive Models.
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Sphingobium baderi LL03 sp. nov
Rok: 2011
-
Sphingobium czechense LL01 sp. nov
Rok: 2011
-
Stereoselectivity and Conformational Stability of Haloalkane Dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110: The Effect of pH and Temperature.
FEBS Journal, rok: 2011, ročník: 278, vydání: 15, DOI
-
Substrate Specificity of Haloalkane Dehalogenases
Biochemical Journal, rok: 2011, ročník: 435, vydání: 435, DOI
2010
-
Biochemical and structural characterization of novel haloalkane dehalogenase DbeA from Bradyrhizobium elkani USDA94 possesing two halide binding sites
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Development of an enzymatic fiber-optic biosensor for detection of halogenated hydrocarbons.
Analytical and Bioanalytical Chemistry, rok: 2010, ročník: 10, vydání: 1007
-
Early Warning Biosensors for Detection of Chemical Warfare Agents.
CHEMICKE LISTY, rok: 2010, ročník: 104, vydání: 104