Informace o projektu
Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií
(DELTA)
- Kód projektu
- GA204/09/0583
- Období řešení
- 1/2009 - 12/2012
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Klíčová slova
- RNA polymeráza
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba Mgr. Libor Krásný, Ph.D.
Pro účinný boj s bakteriálními nemocemi a infekcemi je nezbytná znalost molekulárních mechanismů těchto organismů. Bakteriální RNA polymeráza (RNAP) je esenciální vícepodjednotkový enzym. Na rozdíl od extenzivně studované RNAP z gram negativních baktérií, RNAP z gram pozitivních bakterií obsahuji delta podjednotku. Její role v v buňce není plně objasněna. Navrhujeme provést strukturní, genetické a biochemické studie této podjednotky a definovat tak její roli v regulaci genové exprese. Navrhujeme stanovit 3D strukturu delta podjednotky, určit její pozici na RNAP a za pomoci těchto nových znalostí definovat její fyziologickou roli v buňce.
Publikace
Počet publikací: 19
2010
-
NMR as a tool for studies of (partially) disordered proteins and their interactions
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments
Journal of Biomolecular NMR, rok: 2010, ročník: 46, vydání: 2
-
Solution structure of the N-terminal domain of Bacillus subtilis delta subunit of RNA polymerase and its classification based on structural homologs
Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, rok: 2010, ročník: 78, vydání: 7
-
Strategy for complete NMR assignment of disordered proteins with highly repetitive sequences based on resolution-enhanced 5D experiments
Journal of Biomolecular NMR, rok: 2010, ročník: 48, vydání: 3
-
Structure and dynamics of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Structure and dynamics of RNA polymerase delta subunit from Bacillus subtilis determined by NMR spectroscopy
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Structure determination of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
2009
-
NMR structural study of N-terminal domain of RNA polymerase delta subunit from Bacillus subtilis
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
-
Structural study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty